L'institut JACOB regroupe plusieurs départements dont le Genoscope et le Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) situés à Evry. Ces départements mènent des projets de recherche propres et produisent des données de séquençage à haut-débit pour des projets collaboratifs hautement compétitifs.
Le Genoscope mène des projets de génomique environnementale pour l'exploration de la biodiversité. Après avoir participé au Projet Génome Humain, c'est un acteur majeur de la génomique en France, notamment dans le développement de techniques de séquençage massif d'ADN et d'analyses bioinformatiques.
Le Genoscope est implanté à Evry (91), 30 km au sud de Paris.
Sciences du vivant
Stage
Stagiaire en biologie moléculaire et microbiologie H/F H/F
Le projet DYNAMO-RNAP s'appuie sur CREPE, notre plateforme propriétaire d'édition génomique à haut débit basée sur CRISPR-Cas9, ainsi que sur des systèmes automatisés de culture continue et le séquençage de nouvelle génération (NGS), afin de générer une cartographie complète de l'impact des mutations, à la résolution d'un résidu, sur la fonction de l'ARN polymérase. L'étudiant(e) de Master 2 sélectionné(e) jouera un rôle central dans le déploiement à grande échelle de cette approche de Deep Mutational Scanning (DMS) afin de décrypter de manière systématique les interactions allostériques au sein de l'ARN polymérase.
6
Les principales missions seront les suivantes :
Clonage à haut débit et génération de banques de mutants : construire des banques exhaustives de mutations génomiques localisées et sans cicatrice (scarless) chez Escherichia coli.
Sélection automatisée : utiliser des turbidostats de culture continue de dernière génération afin de réaliser des expériences de compétition parallélisées dans des conditions contrôlées de carence nutritionnelle et/ou de stress.
Séquençage profond génotype-phénotype : préparer et analyser des banques de séquençage d’amplicons à grande échelle (Illumina NovaSeq) afin de suivre l’évolution de la fréquence des variants au cours du temps.
Modélisation intégrative des données : exploiter Python (Pandas, Matplotlib/Seaborn) ainsi que des outils d’analyse structurale afin de comprendre l’impact des mutations sur la fonction de l’ARN polymérase.
Nous recherchons un(e) étudiant(e) ambitieux(se) et très motivé(e), actuellement inscrit(e) en Master 2 ou en école d’ingénieurs, avec une spécialisation en biologie des systèmes, biologie synthétique, microbiologie moléculaire, bio-ingénierie ou biotechnologies.
Compétences recherchées :
Compétences techniques (souhaitées, une formation sera assurée) : expérience pratique des techniques de base en biologie moléculaire (PCR, assemblage Gibson, transformation bactérienne).
Compétences en analyse de données : une connaissance de Python et/ou R pour le traitement de données constitue un atout.
Langues : bonne maîtrise du français et de l’anglais.
Pour toute information complémentaire, veuillez contacter :
Alaksh Choudhury
📧 achoudhu@genoscope.cns.fr
Autre
France, Ile-de-France, Essonne (91)
Anglais (Courant)
Bac+5 - Master 2
MASTER 2 ou Ecole Ingénieurs
Non
01/02/2027
The CEA is the French Alternative Energies and Atomic Energy Commission ("Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives"). It is a public body established in October 1945 by General de Gaulle. A leader in research, development and innovation, the CEA mission statement has two main objectives: To become the leading technological research organization in Europe and to ensure that the nuclear deterrent remains effective in the future.
The CEA is active in four main areas: low-carbon energies, defense and security, information technologies and health technologies. In each of these fields, the CEA maintains a cross-disciplinary culture of engineers and researchers, building on the synergies between fundamental and technological research.
The civilian programs of the CEA received 49% of their funding from the French government, and 30% from external sources (partner companies and the European Union).
The CEA had a budget of 4,3 billion euros.
The CEA is based in ten research centers in France, each specializing in specific fields. The laboratories are located in the Paris region, the Rhône-Alpes, the Rhône valley, the Provence-Alpes-Côte d'Azur region, Aquitaine, Central France and Burgundy. The CEA benefits from the strong regional identities of these laboratories and the partnerships forged with other research centers, local authorities and universities.
