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Stage de recherche sur l'ADNe H/F

IRSN  •  Republic of France (Onsite)  •  3 hours ago
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Job Description

Informations générales

Entité de rattachement

L'Autorité de sûreté nucléaire et de radioprotection est une autorité administrative indépendante créée par la loi du 21 mai 2024 relative à l'organisation de la gouvernance de la sûreté nucléaire et de la radioprotection pour répondre au défi de la relance de la filière nucléaire.

Elle assure, au nom de l'État, le contrôle des activités nucléaires civiles en France et remplit des missions d'expertise, de recherche, de formation et d'information des publics. L'ASNR est composée de fonctionnaires, d'agents de droit public et de salariés de droit privé.

L'ASNR en tant qu'autorité administrative indépendante est soumise au code général de la fonction publique. Ses personnels sont notamment tenus à l'obligation de neutralité et au respect du principe de laïcité.

Référence

2026-1766

Description du poste

Intitulé du poste

Stage de recherche sur l'ADNe H/F

Type de contrat

Convention de stage

Catégorie

Non-Cadre ou Catégorie B

Disponibilité du poste

04/01/2027

Site

Cadarache

Environnement / Organisation / Contexte

L'autorité de de Sûreté Nucléaire et Radioprotection est un acteur de premier plan dans les domaines des activités nucléaires et de la radioprotection, à la fois centre de recherche et pôle d'expertise pluridisciplinaire rassemblant plus de 2000 personnels. Le laboratoire de recherche, LECO, situé à Cadarache (13) réalise des études écologiques et écotoxicologiques sur les effets des radiocontaminants sur la biodiversité. Ce stage de Master 2 s'intègre dans les objectifs du projet MITI RISE eDNA copiloté par l'ASNR et le CNRS. L'objectif général de MITI Rise eDNA est de mieux évaluer la robustesse de l'ADN environnemental comme outil de reconstruction des changements passés de la biodiversité à partir d'archives sédimentaires de rivières.

Mission

La conservation des échantillons constitue une étape essentielle des analyses d'ADN environnemental, mais son influence sur les communautés détectées dans les archives sédimentaires reste encore peu documentée.

Ce stage de Master 2 visera à caractériser les communautés eucaryotes par métabarcoding à partir d'une carotte sédimentaire prélevée en 2026 et à comparer les résultats avec ceux obtenus sur une carotte voisine prélevée en 2020, dont les échantillons ont suivi une stratégie de conservation différente (lyophilisation versus conservation à l'état frais). Les deux carottes ayant été datées, les comparaisons pourront être réalisées entre horizons sédimentaires d'âge équivalent afin d'évaluer l'influence potentielle du mode de conservation sur le signal d'ADN environnemental, tout en tenant compte de la variabilité spatiale inhérente au site d'étude.

Pour répondre à cette question, le/la stagiaire réalisera des amplifications par PCR de marqueurs eucaryotes à partir d'ADN déjà extrait, puis préparera les librairies de séquençage NGS à partir des produits PCR. Les données de séquençage seront traitées à l'aide d'un pipeline bio-informatique pré-définie (OBITools et metabaR), incluant le contrôle et le traitement des séquences, l'assignation taxonomique, ainsi que l'analyse de la diversité taxonomique et de la composition des communautés.

Selon l'avancement du projet, une seconde partie exploratoire pourra être consacrée à l'étude de la taphonomie de l'ADN environnemental en milieu fluvial, à travers l'échantillonnage de l'eau, des sédiments en suspension et des dépôts récents, afin de mieux comprendre les processus de transfert et de préservation de l'ADN avant son enregistrement dans les archives sédimentaires.

Profil recherché

Master 2 en biologie ou bio-informatiques

  • Une première expérience en biologie moléculaire et/ou en analyse de données bio-informatiques (formation inclus)
  • Maîtrise de R et première expérience de l'environnement Linux
  • Une expérience en métabarcoding serait un plus

Télétravail

Non

Diversité

La diversité est une des composantes de la politique RSE, RH et Qualité de Vie au Travail à l’ASNR. Par conséquent, nous accordons la même considération à toutes les candidatures, sans discrimination, pour inclure tous les talents.

Quelles que soient les différences, nous souhaitons attirer, intégrer et fidéliser nos candidats et nos collaborateurs au sein d’un environnement de travail inclusif. L'ASNR conduit une politique active depuis de nombreuses années en faveur de l'égalité des chances au travail et l'emploi des personnes handicapées. Si vous êtes en situation de handicap, n'hésitez pas à nous faire part de vos éventuels besoins spécifiques afin que nous puissions les prendre en compte.

Conformément à l'article L114-1 du code de la sécurité intérieure, le candidat est informé qu'une enquête administrative, destinée à vérifier que son comportement n'est pas incompatible avec l'exercice des fonctions ou des missions envisagées, sera réalisée préalablement à l'affectation ou l'embauche.

D'autre part, l'ASNR en tant qu'autorité administrative indépendante est soumise au code général de la fonction publique. Ses personnels sont notamment tenus à l'obligation de neutralité et au respect du principe de laïcité.

Localisation du poste

Localisation du poste

Europe, France, Provence-Cote d'Azur, Bouches du Rhône (13)

Critères candidat

Langues

Français (4- Langue natale)

IRSN

About IRSN

IRSN – Institute for Radiological Protection and Nuclear Safety – is the French national public expert in nuclear and radiological risks.

Its activities cover all the related scientific and technical issues. Its areas of specialization include the environment and radiological emergency response, human radiation protection in both a medical and professional capacity, and in both normal and post-accident situations, the prevention of major accidents, nuclear reactor safety, as well as safety in plants and laboratories, transport and waste treatment, and nuclear defense expertise.

IRSN interacts with all parties concerned by these risks (public authorities, in particular nuclear safety and security authorities, local authorities, companies, research organizations, stakeholders’ associations, etc.) to contribute to public policy issues relating to nuclear safety, human and environmental protection against ionizing radiation, and the protection of nuclear materials, facilities, and transport against the risk of malicious acts.

Specializations:

- Monitoring environmental radiation and participating in radiological emergency response situations.

- Human radiation protection.

- Prevention of major accidents in nuclear facilities.

- Reactor safety.

- Safety in plants, laboratories, transport, and waste treatment.

- Nuclear defense expertise.

Industry
Biotech & Life Sciences
Company Size
501-1,000 employees
Headquarters
Fontenay-aux-Roses, FR
Year Founded
Unknown
Website
irsn.fr
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